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Les systèmes d’élevage de crevettes ont été confrontés à diverses maladies microbiennes, qui ont causé des pertes économiques délétères pour les communautés d’éleveurs de crevettes dans le monde entier. Dans les systèmes d’élevage de crevettes pénaeides asiatiques, les maladies bactériennes dues aux vibrions ont été signalées comme étant prédominantes. Dans la présente étude, des échantillons ont été prélevés sur des crevettes d’élevage, des géniteurs, de l’eau d’élevage de crevettes, des sédiments, des larves de crevettes et des échantillons d’eau d’écloserie. Au total, 10 espèces de Vibrio ont été identifiées à partir des échantillons prélevés. Vibrio harveyi était le groupe dominant de vibrions dans les sédiments des étangs à crevettes (40 %) et dans les intestins des crevettes (40 %). L’analyse de l’empreinte IS-PCR réalisée pour le typage moléculaire des souches sélectionnées V. harveyi et V. alginolyticus a permis de détecter la variation des souches et de les répartir efficacement dans différents génogroupes. Les empreintes digitales générées ont indiqué la présence de variations dans le nombre de bandes parmi les Vibrio harveyi et les Vibrio alginolyticus. L’analyse du dendrogramme a également confirmé la variabilité génétique indépendante au sein de la même espèce de Vibrio.
