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O Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (VIH-1) sofre mutações rápidas sob a pressão de seleção da imunidade do hospedeiro, o que permite a amplificação de mutações de escape que possibilitam ao vírus escapar à resposta imunitária do hospedeiro. As primeiras sequências rastreáveis do subtipo A do VIH-1 (no repositório de sequências) eram de origem africana e datam de meados dos anos 80. Nos anos seguintes, à medida que os vírus do subtipo A se foram disseminando globalmente, começaram também a aparecer sequências de diferentes partes do mundo. Nas últimas décadas, o subtipo A do VIH-1 estabeleceu-se em certas regiões do mundo, incluindo o Quénia, o Uganda, o Japão, o Azerbaijão, a Bélgica, o Botsuana, a Bielorrússia, o Congo e, recentemente, o Afeganistão e o Paquistão. A análise dos padrões evolutivos de um vírus no contexto das suas populações hospedeiras esclarece as pressões de seleção sobre os vírus que estão associados a meios imunitários específicos do hospedeiro. Este tipo de informação é útil na conceção de vacinas e medicamentos contra o vírus.
