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A queima in situ de resíduos de culturas, praticada pela maioria dos agricultores no noroeste da Índia, deteriora a qualidade do solo e do ambiente. Os fungos têm potencial para a degradação da lenhinocelulose e podem ser utilizados para a decomposição in situ de resíduos de culturas. Foram isoladas espécies de fungos, nomeadamente Aspergillus terreus, A. flavus, A. niger e Penicillium janthinellum, que foram avaliadas com base na atividade de enzimas lignocelulolíticas para determinar o potencial de degradação dos resíduos de culturas. A. flavus e A. terreus mostraram 30% de degradação dos resíduos após 10 dias de incubação e estes fungos não mostraram qualquer efeito secundário no crescimento da cultura do trigo em condições de campo. Verificou-se que a diversidade fúngica aumentou com as práticas de gestão baseadas na AC, as sequências máximas de filo estavam na ordem de Ascomycota> Basidiomycota> Glomeromycota. No entanto, Alternaria, Cercophora e Epicoccum foram os géneros de fungos mais abundantes. A nível de filo, a abundância relativa de Ascomycota variou de 55 a 74%, com a maior dominância registada em sistemas de milho baseados em CA (milho-trigo-mungo) e a menor com arroz-trigo convencional, no entanto, a nível de classe, Sordariomycetes teve a maior abundância seguida de Dothideomycetes e Eurotiomycetes.
