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Das Immunsystem unterscheidet zwischen zwei Gruppen von Fremdstoffen. Die eine Gruppe besteht aus Antigenen, die frei im Körper zirkulieren. Dazu gehören Moleküle, Viren und fremde Zellen. Eine zweite Gruppe besteht aus körpereigenen Zellen, die abweichende MHC-Proteine aufweisen. Je nach Art des fremden Eindringlings kommt es zu zwei verschiedenen Immunreaktionen: Die humorale Reaktion (oder antikörpervermittelte Reaktion) umfasst B-Zellen, die Antigene oder Krankheitserreger erkennen, die in der Lymphe oder im Blut zirkulieren ('Humor' ist ein mittelalterlicher Begriff für Körperflüssigkeit). An der zellvermittelten Reaktion sind hauptsächlich T-Zellen beteiligt, die auf jede Zelle reagieren, die abweichende MHC-Marker aufweist, einschließlich Zellen, in die Krankheitserreger eingedrungen sind, Tumorzellen oder transplantierte Zellen.
