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A digestão anaeróbia é uma série de reacções químicas durante as quais a matéria orgânica é decomposta através das vias metabólicas de microrganismos que ocorrem naturalmente num ambiente pobre em oxigénio. Na natureza, este tipo de decomposição ocorre normalmente em ambientes quentes, húmidos e escuros, como no trato digestivo. Os microrganismos são explorados no processo biotecnológico da digestão anaeróbia, tanto para reduzir a poluição causada pelos resíduos orgânicos como para produzir metano, que pode ser utilizado como combustível. O número e os tipos de microrganismos presentes nos digestores dependem provavelmente do tipo de digestor, das suas condições de funcionamento e da composição dos resíduos. Os digestores anaeróbios podem ser utilizados em quaisquer águas residuais industriais que contenham carbono, ou seja, processamento de alimentos; pasta de papel e papel; açúcar e destilarias; matadouros; soro de queijo e unidades de produção de leite; indústria cervejeira e lamas municipais. Além disso, constituem um método eficaz para transformar resíduos de diferentes tipos, biogás (rico em metano que pode ser utilizado para gerar calor e/ou eletricidade), fibra (que pode ser utilizada como condicionador de solos ricos em nutrientes) e licor (que pode ser utilizado como fertilizante líquido).
