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Das Benthos von Süßwasser stellt eine äußerst diskriminierende Variable dar, da diese Tiere auf Mikrolokalitäten beschränkt sind und ständig natürliche Stoffe erhalten, die in einem Ökosystem produziert werden oder in dieses gelangen. Das Benthos kann in verschmutzten Situationen und einer großen Menge von Organismen überleben, die zu verschiedenen Klassen und Ordnungen gehören. Dazu gehören Nematoden, Anneliden, Arthropoden und Mollusken in einem Süßwasser-Ökosystem. Das Benthos wird in der Regel von zwei Hauptgruppen von Organismen erobert, den Oligochaeten und den Chironomidenlarven, zusätzlich zu der dritten häufigen Gruppe der Mollusken. Krebstiere und verschiedene kleinere Insektenlarven kommen in der Regel in geringerer Anzahl vor. Die Wasserqualität wirkt sich auf die Artenzusammensetzung, die Häufigkeit und die Produktivität der benthischen Süßwasserorganismen aus. Die Struktur und Zusammensetzung dieser Organismen ist ein offensichtlicher Indikator für die Wasserqualität.
