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Do ponto de vista do conhecimento atual, os problemas essenciais da prática são: 1. Descrição e características do sistema, que possui mais ativos protegidos, entendidos como sistemas, entre os quais existem ligações de natureza diferente (física, cibernética, social, organizacional) e há uma variedade de fluxos materiais, energéticos, cibernéticos, etc. 2. Resiliência, vulnerabilidade e adaptabilidade dos sistemas individuais e do sistema de sistemas. 3. Determinação do risco integral, porque no sistema há ativos mais protegidos, que são interligados por ligações e acoplamentos internos, e os seus objetivos são, em muitos casos, conflitantes. 4. Relações entre riscos parciais e integrados e risco integral do sistema. 5. Relações entre o risco integral do sistema de sistemas e os riscos integrais dos sistemas parciais. 6. Os critérios para a segurança integral do sistema de sistemas. 7. Princípios para a gestão do sistema de sistemas num mundo dinamicamente variável (necessários para o funcionamento de instalações críticas). 8. Legislação para a promoção da gestão da segurança do sistema de sistemas. 9. Mecanismos de controlo para monitorizar o nível de segurança das instalações críticas. Um pré-requisito é o pensamento sistémico.
