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Ogni geologo si interroga sull’origine di una formazione geologica e sui minerali che la costituiscono e da cui ha avuto origine. Nelle formazioni sedimentarie, numerosi esempi di minerali e minerali osservati sul campo e studiati in laboratorio provengono da un’origine microbica o strettamente associata, e molti ricercatori geologi, microbiologi, biologi, geochimici e chimici concordano attualmente sul fatto che i microbi possono svolgere un ruolo diretto nella mineralizzazione, ma soprattutto un ruolo importante nell’intrappolamento e nella concentrazione dei metalli. Studi condotti su alcuni orizzonti carbonatici a ooidi, livelli ricchi di solfuro del Giurassico Superiore di Ali Sabieh, pseudopisoliti e pseudooidi di ferro del Cretaceo di Ali Sabieh, travertini carbonatici idrotermali del lago Abhé e del lago Asal, sfere di sale del lago Asal, hanno mostrato mineralizzazioni derivanti da metabolismi microbici. Tra il 1982 e il 1985, lo studio sedimentologico condotto sulla bauxite del Cretaceo medio e sui ferro-fosfati terziari della Grecia continentale ha dimostrato una stretta relazione tra stromatoliti, ooidi e questi minerali.